本片讲述了一群在魔法学院学习的学生，其中一个学生柯豆豆意外身亡，大家怀疑是哈吉娜所害，但是学长路小布发现有很多疑点，为了帮助同学洗脱罪名，开始调查，期间发现同学江兰心也在练习黑暗魔法，为了治疗昏迷很久

迷你世界魔法学院，是一个传授魔法知识和机关陷阱制造技巧的学院。迷斯拉、余小乐、兔美美等人进入魔法学院进修，以便能更好的在迷你大陆上生存，他们都梦想着，成为迷你大陆上真正的最强者。正逢迷你世界魔法学院一

这里是“人”“神”“魔”各个种族混杂在一起的神秘世界密斯塔尔希亚。快活的玛娜莉亚王国公主“安”，内向的龙族公主“古蕾雅”。自两人的相遇之后，玛娜莉亚魔法学院的生活开始了。

在群山中，有一座传说中的魔法学院。立志成为出色魔法师的奥拉，为解开自己的身世之谜，在从小陪伴自己的萌宠机器人德力带领下，寻找到魔法学院并在这里遇到可爱的小龙咘咘和一群拥有魔法的同学。在经历了许多啼笑皆非的冒险后，她们在看似平静的魔法学院里发现了一股神秘的力量，其间隐藏的阴谋让奥拉和小伙伴们危在旦夕，她们该如何冲出这重重危机？

　　在魔法学院中，根据成绩优异的学生被授予的魔法石的数量，来决定个人以及班级的成绩。露琪亚的班级中由于经常因为魔法的失败而导致灾难，使班级的魔法石的获得数处于最后一名。　　因此，班主任的艾蜜莉亚老师打算在学园祭的主要活动-[班级对抗魔法比赛大会]中获得优胜，以此来大量获得魔法石并且洗脱污名，但是……