在他的妻子与黑暗势力的战斗中不幸牺牲后，加布里埃尔被说服重新加入他以前的恶魔猎人团队，从美国相对不为人知的地方旅行到欧洲的未知深处。他与他疏远的最好的朋友迈克尔一起，他有一个黑暗的秘密，神秘的汉娜

故事发生在2138年到2143年之间。在故事设定中，人类文明此时已散布于数千个星系。这之中有个名为“世界福祉事业协会”的企业，简称“3WA”，以帮助各地星系解决问题为业。故事主角莉莉（ユリ ）与亚男（ケイ）就是3WA派遣于各星系的“问题解决专家”。她们这组搭档的正式名称为“Lovely Angels（甜蜜天使）”，但却常常在工作中造成重大损害，因此被人称为带有贬意的“Dirty Pair（“乱七八糟的一对”）”。

“可以喔，我会变大给你看的”E.R.2035年。突然出现的巨大生命体“费亚雷姆”。人类大量投入了战斗型智能机器人“艾克提斯”以与之对抗，但在身长超过50m的费亚雷姆那压倒性的力量面前仍处于无可否认的劣势。为了解决事态，国家议会将利用细胞成长因子CGF-3使生物肥大化的技术应用到军事上，将人类当做巨大兵器投入到实战当中，下达了这样的决断。作为对费亚雷姆特化部队“Ragna Strikers”而被拔擢的6位巨大化适合者女主角。少女们相信着与特务官的牵绊，向强大的敌人挑战。

在一栋大楼最底层甦醒的13岁少女，瑞吉儿·加德纳(レイチェル・ガードナー)，她没有任何记忆，不知道自己为何在这里，而为了回到地面，她开始试着逃出去，但是突然在她面前出现了脸上缠满绷带的奇怪男子。两人之间的奇妙羁绊，随着那“荒诞的约定”而逐渐加深。这里究竟是什么地方？两人为何被禁锢于此？等待着两人的命运又是如何？为了从密闭大楼逃出的抱死觉悟之行揭开了序幕。两人最终是否能够坚守约定，并且安全地逃出这栋大楼呢？